A maioria dos aeroportos estão ligados às grandes cidades mais próximas pelas linhas JR. O Narita Express que liga o aeroporto de Narita às estações de Tóquio, Shinagawa, Shinjuku e Ikebukuro, o Tokyo Monorail que liga o aeroporto de Haneda à estação de Hamamatsucho, ou o expresso limitado Haruka que liga o aeroporto de Kansai a Osaka e Quioto são exemplos disso.